โรงพยาบาลเจ้าพระยายมราช มีห้องพักพิเศษสำหรับผู้ป่วย รองรับผู้ป่วยที่อยู่ระหว่างการพักฟื้น หรือแพทย์เจ้าของไข้เห็นว่าผู้ป่วยไม่อยู่ในภาวะวิกฤต แยกตามแผนกต่าง ๆ เช่น อายุรกรรม ศัลยกรรม สูติ-นรีเวชกรรม กุมารเวชกรรม กระดูกและข้อ และตา หู คอ จมูก จำนวน 153 ห้อง มีอัตราค่าบริการห้องพิเศษหลายราคา เพื่อให้ผู้ป่วยได้เลือกพักได้ตามความต้องการ ห้องพักผู้ป่วยพิเศษทุกห้องได้รับการออกแบบ เพื่อให้ผู้ป่วยได้รับความสะดวก ปลอดภัย และการดูแลติดตามการรักษาด้วยความเอาใจใส่ โดยทีมแพทย์ พยาบาล และเจ้าหน้าที่ที่มีความชำนาญตามสาขาโรค
โรงพยาบาลเจ้าพระยายมราช ได้จัดเตรียมห้องพักพร้อมสิ่งอำนวยความสะดวกครบครัน อาทิ เตียงปรับระดับด้วยระบบไฟฟ้า ปุ่มกดเรียกพยาบาลระบบคอมพิวเตอร์ เคเบิ้ลทีวี สำหรับผู้ป่วย กระติกน้ำร้อน ชุดรับแขก เครื่องปรับอากาศ โทรศัพท์ติดต่อได้ทั้งภายใน และภายนอก เครื่องใช้ภายในห้องน้ำ พร้อมระบบป้องกันความปลอดภัย